牛肉品质较低、产品结构不合理
我国肉牛从品种资源、生产性能到饲养方式等与世界发达国家相比，都有较大差距。我国现有用于生产牛肉的优良品种资源较为匮乏，饲养方式以农民分散经营为主、以中小型育肥场集中育肥为辅 ，缺乏科学的规模管理，易造成育肥期长、育肥效率低、疫病时起时伏、牛肉中农药、激素等残留含量时有超标等 ，从而使中国牛肉品质较低 ，不符合许多发达国家的出口标准 。由于我国牛肉食品行业以初级加工为主 ，产品品种单一，产品市场细分不够，导致无法满足消费者偏好，牛肉出口品质也受到影响。
牛源供应不足、私宰现象泛滥
近年来，全国肉牛养殖都呈萎缩趋势，市场上牛源不足，不仅使农民养殖环节的利润受到挤压，也使肉牛屠宰加工企业面临产量过剩的窘境 。此外 ，在牛肉初级加工的过程中，个体屠宰的比重较大，即使是大型肉联厂能达到国际卫生标准的也很少 ，缺少完整的冷链过程。目前 ，中国牛肉产量来自工厂化系统仅占1%，比例是各类畜产品中最低的，较低的现代化水平极大程度上阻碍了中国牛肉市场的发展。
牛肉分级体系、标准以及检测和监控系统的滞后
我国尚未建立起能够反映牛肉质量的牛肉分级体系和标准 。在屠宰 、加工环节以及环保要求等方面，与发达国家的差距依然很大。由于牛肉检测和监控系统的或缺，国产牛肉尚不能达到国际质量卫生标准 。
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